理 事 长： 顾基发
副理事长： 于景元、 王浣尘、 陈光亚、 汪寿阳、 范文涛、 赵纯均、 韩文秀
秘 书 长： 经士仁

常务理事（34名）：
丁夏畦、于景元、王浣尘、车宏安、方福康、朱广田、李一军、刘奇志、刘应明、成思危
曲晓飞、孙东川、汪成为、汪寿阳、陈　剑、陈玉祥、陈光亚、陈宏民、吴冲锋、经士仁
范文涛、赵纯均、柳克俊、姜　璐、顾基发、顾培亮、徐福缘、夏国平、席酉民、唐小我
韩文秀、程明熙、寇纪淞、魏权龄

专业委员会(15个)和专业学组（2个）：
军事系统工程委员会 、　　社会经济系统工程委员会、　　农业系统工程委员会
系统理论委员会、　　　　 模糊数学与模糊系统委员会、　教育系统工程专业委员会
信息系统工程专业委员会、 科技系统工程专业委员会、　　交通运输系统工程专业委员会
过程系统工程专业委员会、 决策科学专业委员会、　　　　林业系统工程专业委员会
草业系统工程专业委员会、 系统动力学专业委员会、　　　人-机环境系统工程专业委员会
法制系统科学专业学组 、　医药卫生系统工程专业学组

工作委员会（6个）：
学术工作委员会 、教育与普及工作委员会、 编辑出版委员会
青年工作委员会 、国际学术交流委员会 、　中国系统工程学会咨询部

地方组织有40个：
湖南、北京、上海、安徽、湖北、甘肃、黑龙江、福建、河南、云南、四川、广东、天津、辽宁、江苏、新疆、海南、广西、山西、江西等20个，中心城市、地区级20个。